40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0125 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  83.57 
 
 
487 aa  779    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  83.78 
 
 
503 aa  782    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  83.57 
 
 
503 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  83.57 
 
 
503 aa  779    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  93.43 
 
 
487 aa  878    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  94.46 
 
 
487 aa  886    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  83.78 
 
 
503 aa  782    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  83.57 
 
 
487 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  93.43 
 
 
487 aa  878    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 
487 aa  930    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  93.63 
 
 
487 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  83.78 
 
 
487 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  94.25 
 
 
487 aa  892    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  83.78 
 
 
487 aa  782    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  94.46 
 
 
487 aa  886    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  86.24 
 
 
487 aa  810    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  58.92 
 
 
486 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  53.56 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  39.92 
 
 
525 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  41.61 
 
 
565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  41.4 
 
 
582 aa  355  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  36.2 
 
 
499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  35.08 
 
 
543 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  34.88 
 
 
543 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  35.89 
 
 
547 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  24.54 
 
 
275 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  26.67 
 
 
276 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  25.35 
 
 
230 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  25.35 
 
 
246 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  23.7 
 
 
223 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  27.07 
 
 
243 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  30.47 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  28.46 
 
 
239 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  29.23 
 
 
274 aa  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  24.77 
 
 
221 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  26.11 
 
 
255 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  24.74 
 
 
306 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  27.39 
 
 
241 aa  46.6  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  31.21 
 
 
239 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  20.81 
 
 
306 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>