41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2965 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  64.17 
 
 
240 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3200  hypothetical protein  64.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.384687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  64.58 
 
 
240 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  38.17 
 
 
236 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  37.76 
 
 
236 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  38.17 
 
 
235 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  25.1 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  27.98 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  28.71 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  27.23 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  33.16 
 
 
273 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  28.74 
 
 
221 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  25.25 
 
 
227 aa  58.5  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  28.57 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  26.79 
 
 
547 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  23.86 
 
 
276 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  30.23 
 
 
494 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  29.73 
 
 
565 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  29.53 
 
 
582 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  25.35 
 
 
525 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  29.38 
 
 
487 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  24.62 
 
 
499 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  30.5 
 
 
503 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  30.5 
 
 
503 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  30.5 
 
 
487 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  30.5 
 
 
487 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  30.5 
 
 
503 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  30.5 
 
 
503 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  28.87 
 
 
487 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  28.87 
 
 
487 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  28.87 
 
 
487 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  28.87 
 
 
487 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  28.87 
 
 
487 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  30.5 
 
 
487 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  28.7 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  27.85 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  33.66 
 
 
487 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  28.12 
 
 
279 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  29.38 
 
 
487 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  26.96 
 
 
487 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>