60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1684 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 
499 aa  978    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  38.23 
 
 
494 aa  339  8e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  36.44 
 
 
487 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  37.83 
 
 
503 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  37.83 
 
 
503 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  37.83 
 
 
503 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  37.83 
 
 
503 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  37.83 
 
 
487 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  37.83 
 
 
487 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  37.83 
 
 
487 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  36.2 
 
 
487 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  36.2 
 
 
487 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  36.61 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  35.99 
 
 
487 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  38.52 
 
 
547 aa  326  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  35.99 
 
 
487 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  35.99 
 
 
487 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  36.2 
 
 
487 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  38.22 
 
 
543 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  36.81 
 
 
487 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  38.03 
 
 
543 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  36.47 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  33.73 
 
 
525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  34.19 
 
 
582 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  33.97 
 
 
565 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  31.13 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  33.33 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  23.53 
 
 
230 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  30.32 
 
 
275 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  27.08 
 
 
246 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  26.56 
 
 
243 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  26.06 
 
 
276 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  26.58 
 
 
236 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  27.8 
 
 
306 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  23.49 
 
 
275 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  32.49 
 
 
239 aa  57  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  26.51 
 
 
221 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  21.21 
 
 
272 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  27.1 
 
 
235 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  24.68 
 
 
236 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  23.87 
 
 
239 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  29.86 
 
 
257 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  27.27 
 
 
271 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  24.32 
 
 
335 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  24.32 
 
 
335 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  24.32 
 
 
335 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  28.86 
 
 
287 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  28.46 
 
 
229 aa  50.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  30.25 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  30.94 
 
 
274 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  27.7 
 
 
287 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  25.48 
 
 
229 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  23.18 
 
 
306 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  22.82 
 
 
255 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  27.33 
 
 
228 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  37.93 
 
 
274 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  22.45 
 
 
306 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  33.77 
 
 
240 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  27.87 
 
 
261 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  27.52 
 
 
274 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>