42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05319 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  84.19 
 
 		 487 aa  788    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  85.83 
 
 		 487 aa  813    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  86.65 
 
 		 487 aa  821    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  86.24 
 
 		 487 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  84.19 
 
 		 487 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  84.39 
 
 		 503 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  84.39 
 
 		 503 aa  790    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  84.19 
 
 		 503 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  84.19 
 
 		 503 aa  788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  86.45 
 
 		 487 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  85.83 
 
 		 487 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  86.45 
 
 		 487 aa  819    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  931    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  84.39 
 
 		 487 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  85.63 
 
 		 487 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  84.6 
 
 		 487 aa  793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  59.34 
 
 		 486 aa  531  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  53.56 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  42.13 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  41.44 
 
 		 582 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  42.37 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  36.44 
 
 		 499 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  34.95 
 
 		 543 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  34.75 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  35.73 
 
 		 547 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  24.22 
 
 		 275 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  25.71 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  24.88 
 
 		 230 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  31.69 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  24.07 
 
 		 246 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  29.03 
 
 		 239 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  27.23 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  30.41 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  27.33 
 
 		 279 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  25.81 
 
 		 255 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  33.61 
 
 		 240 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  32.14 
 
 		 239 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  23.13 
 
 		 229 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  23.78 
 
 		 306 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  29.01 
 
 		 275 aa  43.5  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  25.35 
 
 		 241 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>