50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0517 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  531  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  55.56 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  50.19 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  58.8 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  58.8 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  55.56 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  55.65 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  51.17 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  45.99 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  42.7 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  46.27 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  37.83 
 
 		 358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  35.1 
 
 		 460 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  30.81 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  24.88 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  29.06 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  23.49 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  30.1 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  28.14 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  26.77 
 
 		 582 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  23.81 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  26.26 
 
 		 565 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  25.45 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  26.17 
 
 		 547 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  23.81 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  27.33 
 
 		 503 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  27.33 
 
 		 503 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  27.33 
 
 		 503 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  27.33 
 
 		 503 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  27.33 
 
 		 487 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  27.33 
 
 		 487 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  27.33 
 
 		 487 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  27.33 
 
 		 487 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  34.15 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  24.89 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  24.67 
 
 		 525 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  25.85 
 
 		 543 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  31.3 
 
 		 487 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  26.19 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  26.06 
 
 		 543 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  34.38 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  29.01 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  30.77 
 
 		 487 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  30.71 
 
 		 486 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  33.03 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  27.91 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  28.79 
 
 		 494 aa  42.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  26.71 
 
 		 487 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  26.71 
 
 		 487 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  24.31 
 
 		 306 aa  42  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>