187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05325 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05325  Phytoene dehydrogenase C terminal region  100 
 
 		 238 aa  498  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.156493  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  54.17 
 
 		 553 aa  264  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  48.85 
 
 		 525 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  47.27 
 
 		 529 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  46.12 
 
 		 530 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  46.12 
 
 		 530 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  47 
 
 		 530 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  40.81 
 
 		 504 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  39.35 
 
 		 492 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  39.09 
 
 		 493 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  39.09 
 
 		 492 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  37.1 
 
 		 511 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  40.47 
 
 		 494 aa  166  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  37.21 
 
 		 511 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  34.68 
 
 		 505 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  36.74 
 
 		 511 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  35.48 
 
 		 508 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  38.89 
 
 		 497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  37.62 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  35.27 
 
 		 512 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  34.84 
 
 		 507 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  37.39 
 
 		 502 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  37.39 
 
 		 502 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  35 
 
 		 492 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  36.28 
 
 		 518 aa  145  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  35.35 
 
 		 508 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  36.28 
 
 		 509 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  33.49 
 
 		 507 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  35.35 
 
 		 512 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  33.33 
 
 		 504 aa  141  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  35.32 
 
 		 509 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  34.88 
 
 		 512 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  33.95 
 
 		 508 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  34.88 
 
 		 512 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  33.04 
 
 		 556 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  34.53 
 
 		 504 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  34.25 
 
 		 531 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  33.49 
 
 		 537 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  33.49 
 
 		 508 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  32.74 
 
 		 552 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  32.09 
 
 		 508 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  32.61 
 
 		 546 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  36.41 
 
 		 495 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  33.64 
 
 		 495 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  35.48 
 
 		 509 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  32.29 
 
 		 553 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  30.8 
 
 		 549 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  31.51 
 
 		 492 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  34.09 
 
 		 498 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  36.45 
 
 		 491 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  37.84 
 
 		 506 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  34.33 
 
 		 498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  34.39 
 
 		 499 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  32.27 
 
 		 527 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  36.62 
 
 		 502 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  37.84 
 
 		 492 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  34.36 
 
 		 502 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  32.08 
 
 		 490 aa  121  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  33.79 
 
 		 506 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  30.73 
 
 		 492 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  29.22 
 
 		 518 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  33.64 
 
 		 503 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  28.38 
 
 		 518 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  28.38 
 
 		 518 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  32.41 
 
 		 494 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  36.22 
 
 		 492 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  29.77 
 
 		 496 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  30.37 
 
 		 519 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  30.37 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  31.31 
 
 		 511 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  29.28 
 
 		 524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  28.83 
 
 		 500 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  31.25 
 
 		 519 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  29.3 
 
 		 519 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  31.46 
 
 		 536 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  31.36 
 
 		 495 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  31.12 
 
 		 512 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  31.12 
 
 		 512 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  31.12 
 
 		 512 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  28.84 
 
 		 521 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  28.64 
 
 		 490 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  28.57 
 
 		 491 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  32.14 
 
 		 501 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  29.59 
 
 		 497 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  29.59 
 
 		 497 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  31.36 
 
 		 504 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  29.95 
 
 		 506 aa  99  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  30.3 
 
 		 494 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  29.02 
 
 		 526 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  30.27 
 
 		 471 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  29.83 
 
 		 503 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  31.9 
 
 		 507 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  35.71 
 
 		 496 aa  91.7  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  23.21 
 
 		 566 aa  90.1  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  27.1 
 
 		 552 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  31.75 
 
 		 475 aa  88.2  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  28.64 
 
 		 548 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  29.44 
 
 		 542 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  26.57 
 
 		 452 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  25.99 
 
 		 497 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>