More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6704 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6704  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 		 374 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5446  hypothetical protein  38 
 
 		 166 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5444  hypothetical protein  34.75 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  25 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  30.72 
 
 		 1101 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 1578 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  29.23 
 
 		 800 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1611 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  31.63 
 
 		 237 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  29.14 
 
 		 1852 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1202  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.82 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1090 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1090 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.15 
 
 		 243 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1068 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 119 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1058 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 316 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 844 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1206  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 145 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 844 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  29.56 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.83 
 
 		 236 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.65 
 
 		 230 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 249 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 228 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 126 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 563 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 232 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 		 1002 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  27.52 
 
 		 237 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 1767 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 1767 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  31.91 
 
 		 810 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 563 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.03 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 235 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1099 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0067  histidine kinase  32.61 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1027 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  25.93 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0548  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  28.68 
 
 		 570 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  31.03 
 
 		 1177 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 564 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  28.25 
 
 		 228 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  28.04 
 
 		 234 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.23 
 
 		 242 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 221 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.04 
 
 		 240 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 139 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  28.83 
 
 		 736 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  30 
 
 		 121 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.88 
 
 		 932 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 132 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.33 
 
 		 762 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  28.57 
 
 		 819 aa  49.7  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 		 1141 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  27.1 
 
 		 250 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1362 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.75 
 
 		 835 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  34.41 
 
 		 123 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  28.44 
 
 		 241 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1672 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.64 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  25 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 957 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 132 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0106  two component transcriptional regulator  25.52 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  30.86 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  27.78 
 
 		 777 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  30.63 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 921 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.31 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.55 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.5 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  26.47 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  23.42 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.46 
 
 		 1348 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 827 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  30.21 
 
 		 761 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.7 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  27.1 
 
 		 128 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  28 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.91 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  31.3 
 
 		 698 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  28 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  28 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>