71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3884 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 1852 aa  3643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  37.64 
 
 		 1101 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  40.46 
 
 		 387 aa  289  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  40.2 
 
 		 387 aa  287  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  38.14 
 
 		 379 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  38.26 
 
 		 381 aa  238  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  39.17 
 
 		 373 aa  237  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  36.24 
 
 		 365 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  36.14 
 
 		 379 aa  227  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  35.66 
 
 		 377 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  33.25 
 
 		 395 aa  219  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  37.67 
 
 		 395 aa  218  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  27.32 
 
 		 408 aa  126  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  29.68 
 
 		 401 aa  120  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  27.79 
 
 		 417 aa  116  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  27.02 
 
 		 629 aa  116  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.68 
 
 		 931 aa  115  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  29.9 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.94 
 
 		 932 aa  107  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  25.91 
 
 		 933 aa  95.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  24.93 
 
 		 383 aa  95.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  28.99 
 
 		 396 aa  94  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  26.2 
 
 		 375 aa  93.2  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.43 
 
 		 387 aa  92.8  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  28.85 
 
 		 396 aa  92  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  23.44 
 
 		 934 aa  91.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  88.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  26.76 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  28.22 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  27.76 
 
 		 416 aa  78.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  25.87 
 
 		 389 aa  77.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  31.38 
 
 		 829 aa  76.3  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.02 
 
 		 396 aa  75.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 396 aa  74.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5444  hypothetical protein  26.83 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.98 
 
 		 379 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5446  hypothetical protein  26.95 
 
 		 166 aa  68.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  29.05 
 
 		 828 aa  64.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  32.12 
 
 		 389 aa  63.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.17 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  28.26 
 
 		 828 aa  60.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6704  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.14 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  23.53 
 
 		 350 aa  57  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  30 
 
 		 400 aa  57  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  28.69 
 
 		 385 aa  55.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  24.92 
 
 		 379 aa  55.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  32.82 
 
 		 386 aa  53.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  29.85 
 
 		 385 aa  53.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  34.81 
 
 		 384 aa  52.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  27.88 
 
 		 392 aa  52.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  34.81 
 
 		 384 aa  52.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  28.1 
 
 		 374 aa  52.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  34.81 
 
 		 392 aa  52.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  34.81 
 
 		 392 aa  52.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  34.81 
 
 		 392 aa  52.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  34.81 
 
 		 392 aa  52.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  30.24 
 
 		 389 aa  51.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  29.75 
 
 		 386 aa  51.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  29.75 
 
 		 386 aa  51.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.92 
 
 		 951 aa  51.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  31.3 
 
 		 386 aa  51.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  29.55 
 
 		 385 aa  49.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  25.36 
 
 		 382 aa  48.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  25.3 
 
 		 382 aa  47.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  32.65 
 
 		 464 aa  47.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  24.78 
 
 		 404 aa  47  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  23.75 
 
 		 460 aa  47  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.62 
 
 		 947 aa  47  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  23.64 
 
 		 377 aa  46.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.14 
 
 		 376 aa  45.8  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  27.58 
 
 		 401 aa  45.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>