96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1520 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 1101 aa  2215    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  37.64 
 
 		 1852 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  51.16 
 
 		 387 aa  403  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  51.16 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  47.11 
 
 		 395 aa  323  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  44.24 
 
 		 379 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  44.27 
 
 		 373 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  42.3 
 
 		 377 aa  301  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  42.32 
 
 		 381 aa  289  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  41.04 
 
 		 379 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  41.97 
 
 		 395 aa  279  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  42.27 
 
 		 365 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  29.76 
 
 		 417 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  30.9 
 
 		 383 aa  136  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  26.54 
 
 		 408 aa  132  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  28.03 
 
 		 401 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  28.61 
 
 		 400 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  27.87 
 
 		 375 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  25.12 
 
 		 629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  27.2 
 
 		 402 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  27.99 
 
 		 389 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  26.98 
 
 		 933 aa  105  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  28.99 
 
 		 376 aa  105  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25.27 
 
 		 396 aa  104  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.54 
 
 		 396 aa  104  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  25.89 
 
 		 387 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5446  hypothetical protein  36.3 
 
 		 166 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18512 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.68 
 
 		 932 aa  91.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.16 
 
 		 379 aa  89.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  24.92 
 
 		 396 aa  88.2  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  23.87 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.85 
 
 		 931 aa  83.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5444  hypothetical protein  28.07 
 
 		 278 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  22.71 
 
 		 934 aa  78.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  26.34 
 
 		 400 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  28.99 
 
 		 386 aa  77  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  28.45 
 
 		 416 aa  77  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  26.7 
 
 		 828 aa  75.5  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  25.67 
 
 		 401 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  26.77 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6704  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.72 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.53 
 
 		 951 aa  64.3  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  30.16 
 
 		 371 aa  64.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.28 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  24.85 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  28.22 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  25.62 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  26.37 
 
 		 384 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  26.37 
 
 		 384 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  26.37 
 
 		 392 aa  57  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  26.37 
 
 		 392 aa  57.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  26.37 
 
 		 392 aa  57  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  26.37 
 
 		 392 aa  57  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  26.37 
 
 		 392 aa  57  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  25.47 
 
 		 380 aa  57.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  23.56 
 
 		 382 aa  56.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  24.29 
 
 		 350 aa  55.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  24.28 
 
 		 379 aa  55.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  26.38 
 
 		 400 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  22.07 
 
 		 396 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  23.08 
 
 		 381 aa  53.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  29.96 
 
 		 385 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  23.4 
 
 		 382 aa  52.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  27.1 
 
 		 383 aa  52.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.25 
 
 		 512 aa  52.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  24.12 
 
 		 829 aa  52  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  25.45 
 
 		 386 aa  51.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  26.88 
 
 		 412 aa  50.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  26.3 
 
 		 374 aa  51.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  25.28 
 
 		 402 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  26.26 
 
 		 399 aa  50.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  24.49 
 
 		 378 aa  49.7  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  27.78 
 
 		 374 aa  50.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  24.49 
 
 		 378 aa  49.7  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  22.93 
 
 		 382 aa  49.3  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  23.64 
 
 		 404 aa  49.3  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  25.24 
 
 		 398 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  25.13 
 
 		 379 aa  48.5  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  26.3 
 
 		 408 aa  48.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  24.06 
 
 		 468 aa  48.5  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  27.2 
 
 		 398 aa  47.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  27.31 
 
 		 387 aa  47.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  26.75 
 
 		 378 aa  47.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  23.68 
 
 		 406 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  22.97 
 
 		 377 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  23.6 
 
 		 431 aa  47.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  24.92 
 
 		 385 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  25.49 
 
 		 384 aa  46.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  27.6 
 
 		 389 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  26.99 
 
 		 398 aa  45.8  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  20.27 
 
 		 394 aa  45.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  30.21 
 
 		 396 aa  45.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  23.24 
 
 		 379 aa  44.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  26.88 
 
 		 386 aa  44.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  26.88 
 
 		 386 aa  44.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  28.5 
 
 		 383 aa  44.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>