271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1519 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1519  surface antigen (D15)  100 
 
 
882 aa  1745    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1473  surface antigen (D15)  26.66 
 
 
856 aa  197  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000179625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.97 
 
 
808 aa  104  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.33 
 
 
802 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.4 
 
 
807 aa  87  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  22.66 
 
 
751 aa  85.1  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.24 
 
 
752 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  24.8 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  20.61 
 
 
888 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  22.12 
 
 
781 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.12 
 
 
781 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.01 
 
 
760 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  25.61 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.93 
 
 
892 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.67 
 
 
763 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  22.22 
 
 
752 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  22.41 
 
 
769 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  22.31 
 
 
739 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  21.95 
 
 
739 aa  75.1  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.48 
 
 
772 aa  75.1  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  23.29 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  21.21 
 
 
913 aa  74.3  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  21.76 
 
 
765 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  23.37 
 
 
757 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  21.76 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  23.58 
 
 
647 aa  72  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  23.7 
 
 
739 aa  72  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  21.84 
 
 
763 aa  72  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  20.92 
 
 
779 aa  71.2  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.83 
 
 
785 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  21.95 
 
 
791 aa  70.1  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.72 
 
 
765 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.28 
 
 
895 aa  68.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.49 
 
 
749 aa  68.6  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  21.82 
 
 
794 aa  68.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  20.67 
 
 
765 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
633 aa  66.6  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  21.72 
 
 
763 aa  65.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  20.78 
 
 
765 aa  65.1  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 
775 aa  65.1  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  24.68 
 
 
613 aa  65.1  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  23.22 
 
 
794 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.57 
 
 
765 aa  65.1  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  35.4 
 
 
607 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.96 
 
 
797 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  20.57 
 
 
765 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  24.93 
 
 
637 aa  63.9  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  19.94 
 
 
769 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  19.94 
 
 
768 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  19.94 
 
 
768 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  19.94 
 
 
768 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  19.94 
 
 
768 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.98 
 
 
745 aa  62  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.25 
 
 
769 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.25 
 
 
769 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.96 
 
 
759 aa  62.4  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  21.49 
 
 
781 aa  62  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  22.41 
 
 
768 aa  62  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.18 
 
 
790 aa  61.6  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.49 
 
 
803 aa  62  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  37.5 
 
 
575 aa  62  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.69 
 
 
769 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.97 
 
 
768 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  22.41 
 
 
769 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  22.41 
 
 
769 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  37.78 
 
 
696 aa  61.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  22.97 
 
 
769 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  21.69 
 
 
784 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.41 
 
 
768 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  20.78 
 
 
785 aa  60.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  21.02 
 
 
765 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  32.74 
 
 
576 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  22.01 
 
 
841 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.94 
 
 
804 aa  60.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.02 
 
 
750 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  32.74 
 
 
618 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.69 
 
 
751 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.41 
 
 
769 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.74 
 
 
770 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.17 
 
 
765 aa  59.7  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.91 
 
 
895 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.6 
 
 
758 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  24.51 
 
 
620 aa  58.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  20.63 
 
 
578 aa  58.2  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  21.86 
 
 
792 aa  57.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  31.25 
 
 
588 aa  57.8  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  21.58 
 
 
790 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.61 
 
 
784 aa  57.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  22.15 
 
 
786 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  30.34 
 
 
674 aa  57  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  24.28 
 
 
661 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  18.39 
 
 
769 aa  57  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  23.36 
 
 
661 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  33.71 
 
 
579 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  29.41 
 
 
627 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  27.03 
 
 
573 aa  56.2  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  21.79 
 
 
770 aa  56.2  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.59 
 
 
769 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  23.36 
 
 
661 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  21.44 
 
 
790 aa  55.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>