211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7142 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7142  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  65.18 
 
 		 250 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  60.19 
 
 		 252 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 267 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  55.88 
 
 		 254 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 251 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 251 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  46.3 
 
 		 251 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  46.36 
 
 		 253 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 251 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 251 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 251 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 251 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 251 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  41.96 
 
 		 252 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  48.31 
 
 		 251 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  47.46 
 
 		 251 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  39.42 
 
 		 248 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  51.04 
 
 		 251 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  44.76 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  38.83 
 
 		 261 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  37.72 
 
 		 258 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  31.9 
 
 		 249 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  37.27 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  35.4 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  35.59 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  32 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  27.68 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  29.73 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  31.53 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 259 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 231 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.7 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  29.41 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  33.67 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 255 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 		 257 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 257 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  26.5 
 
 		 253 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 249 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 251 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  27.45 
 
 		 248 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  32.43 
 
 		 245 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 251 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 251 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  27.45 
 
 		 248 aa  50.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  28.04 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 		 257 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  29.31 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 253 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 269 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  33.66 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  30.51 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 		 250 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 256 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  26.85 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  27.35 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 256 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  26.92 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  35.35 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 253 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  30.93 
 
 		 264 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  30.1 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  30.1 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 254 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  28.57 
 
 		 278 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 254 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 259 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  30.28 
 
 		 248 aa  47  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  29.73 
 
 		 247 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  28.26 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  30.97 
 
 		 267 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  28.95 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.33 
 
 		 257 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  27 
 
 		 257 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.46 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  32.04 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>