More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0957 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 355 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  74.64 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  57.85 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.14 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.82 
 
 		 351 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  54.44 
 
 		 344 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.98 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  55.43 
 
 		 331 aa  311  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.13 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  55.18 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  53.33 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  51.54 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  53.14 
 
 		 336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  56.94 
 
 		 374 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  56.07 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  55 
 
 		 326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  51.79 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  53.3 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  56.8 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  53.04 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  55.78 
 
 		 369 aa  302  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  55.94 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  56.25 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  56.25 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  55.45 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  53.33 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.43 
 
 		 348 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  50 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  52.5 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.32 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  54.26 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  47.67 
 
 		 371 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  52.6 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  54.74 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  55.42 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  51.74 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  40.75 
 
 		 343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.21 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  40.75 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  38.43 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  35.07 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  38.83 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  38.58 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  38.58 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  38.26 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  38.87 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.06 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.69 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  39.5 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.93 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.64 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  32.03 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  37.96 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  37.22 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  37.96 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  37.96 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.51 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.81 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.63 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.97 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  34.43 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.48 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.98 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.31 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.58 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  30.83 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  34.67 
 
 		 353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  34.21 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.55 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.5 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  40.91 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  33.7 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  38.26 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  38.26 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  34.42 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  35.06 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.87 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.87 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.87 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  34.07 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  34.09 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.01 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  33.83 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  35.87 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  35.87 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  35.87 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  35.87 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  35.87 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>