More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2654 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  90.3 
 
 		 371 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  100 
 
 		 371 aa  732    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.66 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  56.18 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  58.21 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  54.03 
 
 		 339 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  54.6 
 
 		 355 aa  338  8e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  54.24 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  51.22 
 
 		 350 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  51.68 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  53.06 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50 
 
 		 333 aa  319  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  51.14 
 
 		 361 aa  316  5e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  52.15 
 
 		 366 aa  315  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  49.58 
 
 		 336 aa  315  8e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  49.3 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  51.29 
 
 		 328 aa  308  9e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  53.14 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  52.42 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  53.94 
 
 		 337 aa  299  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  52.54 
 
 		 334 aa  298  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  47.03 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  50 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.86 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  50.3 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.3 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  49.02 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  50.16 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  52.06 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  52.06 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  51.64 
 
 		 326 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  50 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.67 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  50.47 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.57 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.66 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  35.2 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  38.33 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.33 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  33.03 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  37.44 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 313 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  28.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.05 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  28.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  28.05 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  28.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  28.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  28.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  28.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  28.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  33.03 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.91 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  37.64 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  32.73 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  37.64 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  31.56 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  32.43 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  32.43 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  31.56 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  31.56 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.33 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  31.56 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  34.51 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  31.56 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  32.43 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.48 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  30.84 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  28.08 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  30.84 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  30.84 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  30.84 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  32.24 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.24 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  30.61 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  31.44 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  30.98 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  31.17 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.21 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  31.88 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  31.33 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.6 
 
 		 319 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.58 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  33.77 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  31.71 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.53 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  30.29 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1842  GTPase EngC  33.45 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  30.75 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  30.75 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  30.75 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  32.31 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  31.58 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>