More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 333 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  75.48 
 
 		 335 aa  461  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  66.26 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  63.83 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  64.29 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  66.06 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  67 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  67 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  59.65 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  66.56 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  65.26 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  60.69 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  64.12 
 
 		 330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  59.44 
 
 		 353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.27 
 
 		 339 aa  358  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  61.42 
 
 		 374 aa  358  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  60.06 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.28 
 
 		 351 aa  351  8.999999999999999e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  60.88 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  59.82 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  62.65 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  58.19 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.04 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  59.08 
 
 		 336 aa  335  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  57.31 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  59.37 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.75 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  56.77 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.14 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  59.58 
 
 		 334 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  50 
 
 		 371 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  50 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  54.01 
 
 		 366 aa  311  6.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.16 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  54.9 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  55.81 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.7 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.7 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  34.36 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.55 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.96 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.08 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  37.76 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32.11 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.03 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  36.49 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  30.6 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  37.04 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.53 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  31.88 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  36.82 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.07 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.07 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  30.34 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.09 
 
 		 343 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.78 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  38.52 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.17 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.06 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.47 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 354 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.89 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.93 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.58 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.92 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  35.39 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  36.07 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.66 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.09 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.09 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  36.09 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  32.07 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  32.07 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  32.07 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  38.08 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.72 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  35.16 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  34.93 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  32.3 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>