More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3772 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  100 
 
 		 328 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  74.64 
 
 		 355 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  58.38 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  62.65 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  60.43 
 
 		 331 aa  346  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  56.93 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.57 
 
 		 351 aa  339  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  55.91 
 
 		 353 aa  329  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  59.22 
 
 		 335 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  55.88 
 
 		 344 aa  325  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.76 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  52.3 
 
 		 371 aa  319  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  51.29 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.8 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  56.42 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  54.32 
 
 		 343 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  58.61 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.37 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  54.09 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  55.65 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  56.05 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  55.49 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  57.46 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  58.28 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  56.67 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  57.81 
 
 		 326 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  57.81 
 
 		 326 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  56.59 
 
 		 374 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  58.28 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.1 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  54.95 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  56.07 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  52.07 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  56.02 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  53.52 
 
 		 368 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  55.7 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.74 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  38.49 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  36.53 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.68 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  37.36 
 
 		 350 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  37 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  37 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  37 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  37 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.23 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.23 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.23 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.95 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  37.74 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.24 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.24 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.24 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  34.15 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.84 
 
 		 350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  36.98 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  33.84 
 
 		 350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  41.42 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.74 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  35.07 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  36.26 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  35.06 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  35.06 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.91 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  38.35 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  35.06 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  41.82 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  38.35 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  35.07 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 354 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  30.77 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.1 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  36.4 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.1 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.88 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  36.1 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  34.44 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  31.61 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.46 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  31.6 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.7 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>