More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3715 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  100 
 
 		 331 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  70.06 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  67.62 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  71.69 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  67.88 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  65.36 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  64.67 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  62.21 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  64.08 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  66.98 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  61.58 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  60.65 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  64.44 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  66.77 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  62.88 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  61.16 
 
 		 374 aa  358  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  59.29 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  61.63 
 
 		 361 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  61.52 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  65.58 
 
 		 337 aa  352  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  62.15 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.43 
 
 		 339 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  53.33 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  53.06 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  56.5 
 
 		 343 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  56.62 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.77 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  57.28 
 
 		 330 aa  325  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.94 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.97 
 
 		 366 aa  312  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  56.29 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  57.28 
 
 		 326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  57.28 
 
 		 326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  56.77 
 
 		 326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  58.09 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  57.65 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.94 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.29 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  41.67 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  39.39 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  39.39 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  39.39 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.02 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  38.64 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  39.02 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  39.02 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.45 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.79 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.6 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  40.91 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.95 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  41.29 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  41.29 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  34.96 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  37.08 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  37.08 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.71 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  37.08 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.83 
 
 		 352 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.91 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.33 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  35.29 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.58 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.89 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.06 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  36.53 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.56 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.47 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.95 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.8 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  38.78 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.18 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.4 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.58 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.25 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  37.83 
 
 		 370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  32.72 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  28.95 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  37.86 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  40 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  36.63 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  32.09 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.72 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  36.53 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.03 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  36.71 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  35.21 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  35.21 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.08 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>