More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  100 
 
 
339 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  61.1 
 
 
349 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  63.31 
 
 
331 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  63.25 
 
 
369 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  54.82 
 
 
371 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  54.82 
 
 
371 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  58.86 
 
 
350 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.48 
 
 
333 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.09 
 
 
351 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  57.27 
 
 
344 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  62.61 
 
 
334 aa  346  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  59.3 
 
 
361 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  57.44 
 
 
336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  55.71 
 
 
353 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  56.82 
 
 
355 aa  329  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.12 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  54.15 
 
 
343 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.01 
 
 
338 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  58.13 
 
 
335 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  56.79 
 
 
334 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  53.82 
 
 
366 aa  309  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  54.25 
 
 
343 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.59 
 
 
339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  59.94 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  58.36 
 
 
330 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  53.62 
 
 
374 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  54.57 
 
 
328 aa  298  9e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  57.23 
 
 
326 aa  295  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.52 
 
 
348 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  56.09 
 
 
326 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  56.63 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.57 
 
 
355 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  55.56 
 
 
326 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  55.56 
 
 
326 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  54.9 
 
 
326 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  51.36 
 
 
368 aa  275  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.31 
 
 
375 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.77 
 
 
319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  39.11 
 
 
351 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 
340 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.64 
 
 
300 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  41.07 
 
 
343 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.07 
 
 
296 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.28 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  39.73 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.27 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  39.27 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.76 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.27 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  35.38 
 
 
319 aa  126  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.27 
 
 
354 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  34.86 
 
 
344 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.27 
 
 
354 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.24 
 
 
316 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  38.15 
 
 
343 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  32.24 
 
 
351 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.64 
 
 
354 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.27 
 
 
352 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.82 
 
 
354 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  34.78 
 
 
367 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.99 
 
 
346 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1842  GTPase EngC  35.71 
 
 
257 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.03 
 
 
347 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
347 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  29.78 
 
 
311 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.12 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.62 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  30.94 
 
 
354 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  30.94 
 
 
354 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  31.7 
 
 
352 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  30.94 
 
 
354 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  30.94 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.01 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.71 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.71 
 
 
293 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 
353 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  34.66 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  32.39 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  33.33 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.57 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.32 
 
 
294 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  31.14 
 
 
343 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  34.29 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.87 
 
 
292 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  31.98 
 
 
349 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.83 
 
 
292 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.09 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 
349 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  29.86 
 
 
351 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  33.96 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  32.63 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  29.6 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>