More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1208 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  100 
 
 		 369 aa  716    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  62.01 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  62.99 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  63.8 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  58.21 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  65.57 
 
 		 331 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  62.02 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  67.17 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  57.02 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  60.53 
 
 		 343 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  62.46 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  63.11 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.73 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  61.22 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  56.37 
 
 		 353 aa  344  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  56.83 
 
 		 368 aa  338  8e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  56.72 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  60 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.49 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  62.25 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  56.06 
 
 		 374 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  57.36 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  55.88 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.76 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.12 
 
 		 339 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.14 
 
 		 348 aa  316  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  56.76 
 
 		 336 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  58.9 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  57.78 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  56.97 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  59.49 
 
 		 330 aa  299  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.65 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  57.98 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  57.98 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  58.41 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  57 
 
 		 326 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.43 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.57 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  42.92 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.08 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  40.18 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  38.06 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  32.37 
 
 		 347 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.78 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.86 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.69 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.01 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  35.41 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.37 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 313 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.7 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.76 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.97 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  37.05 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  40.71 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  40.71 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  40.71 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.97 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.79 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  37.05 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.79 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  43.81 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  29.9 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  37.78 
 
 		 352 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  34.83 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  37.11 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  40.71 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.95 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.29 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.08 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  29.32 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.18 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  34.35 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  35.86 
 
 		 314 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  35.86 
 
 		 314 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  35.86 
 
 		 314 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  35.86 
 
 		 314 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  31.94 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.64 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  31.94 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.08 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  31.94 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  31.94 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  32.26 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.2 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.25 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>