More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1068 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  77.82 
 
 		 293 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  68.94 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  68.94 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  68.6 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  67.58 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  67.58 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  67.58 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  67.58 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  67.58 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  67.58 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  67.58 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  67.24 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  51.2 
 
 		 290 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  47.87 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  49.66 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.3 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  49.14 
 
 		 290 aa  289  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.36 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  46.67 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  46.26 
 
 		 291 aa  268  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  46.26 
 
 		 291 aa  268  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.12 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.65 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.47 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.63 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.7 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.05 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.75 
 
 		 290 aa  242  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.33 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  42.66 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  46.71 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.88 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.53 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.53 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.21 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  43.45 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.64 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.6 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  42.81 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.75 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  42.09 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.87 
 
 		 282 aa  221  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  40.13 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  45.89 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.93 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.07 
 
 		 290 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  38.59 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.86 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  38.21 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.46 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.4 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.94 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.1 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.21 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  35.67 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.22 
 
 		 375 aa  189  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  41.15 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  41.15 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  41.15 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.94 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  37.68 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  40 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.88 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  36.97 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  39.61 
 
 		 350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  37.84 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.89 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  36.24 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.56 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.86 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  39.29 
 
 		 350 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  39.29 
 
 		 350 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  39.29 
 
 		 350 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.1 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  39.29 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  39.52 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.89 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  41.18 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  37.09 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.04 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  37.12 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  37.12 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  37.12 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  37.15 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  35.31 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  37.37 
 
 		 349 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>