More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_07680 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 
366 aa  715    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  61.94 
 
 
371 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  59.66 
 
 
371 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  56.18 
 
 
349 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  56.45 
 
 
344 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  57.64 
 
 
355 aa  332  9e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  53.12 
 
 
343 aa  315  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  55.49 
 
 
369 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  51.11 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  54.9 
 
 
361 aa  308  6.999999999999999e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  51.51 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  55.81 
 
 
328 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.16 
 
 
333 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  53.89 
 
 
368 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  52.59 
 
 
343 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  53.33 
 
 
339 aa  297  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  54.24 
 
 
326 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  53.31 
 
 
366 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.91 
 
 
338 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.86 
 
 
351 aa  288  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  53.92 
 
 
326 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  52.97 
 
 
331 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  54.52 
 
 
334 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  53.85 
 
 
326 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  53.85 
 
 
326 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  53.37 
 
 
326 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  53.1 
 
 
330 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  47.77 
 
 
336 aa  278  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  51.8 
 
 
334 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  53.19 
 
 
337 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  53.85 
 
 
330 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.57 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.32 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.71 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  47.89 
 
 
374 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  49.69 
 
 
335 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.9 
 
 
319 aa  135  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.98 
 
 
374 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  38.11 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.93 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  32.37 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  32.37 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  32.37 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  33.33 
 
 
367 aa  116  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  33.91 
 
 
350 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 
350 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  33.56 
 
 
350 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.87 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
322 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 
343 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.18 
 
 
319 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  36.24 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.33 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
349 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  34.39 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  34.39 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  32.86 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  34.39 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  31.46 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.8 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  34.42 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.02 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  32.52 
 
 
347 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.53 
 
 
347 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  34.95 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  34.17 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.41 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.61 
 
 
319 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.72 
 
 
318 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.98 
 
 
358 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  28.3 
 
 
306 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.84 
 
 
292 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.96 
 
 
319 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1409  GTPase EngC  32.44 
 
 
306 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  32.38 
 
 
313 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  32.38 
 
 
313 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  29.71 
 
 
340 aa  106  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.54 
 
 
346 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  30.54 
 
 
313 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.48 
 
 
316 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  35.52 
 
 
343 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  32.38 
 
 
314 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  31.25 
 
 
314 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 
354 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1697  GTPase EngC  30.77 
 
 
324 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  31.25 
 
 
314 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  31.25 
 
 
314 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  32.38 
 
 
314 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  31.25 
 
 
314 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>