More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0563 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  98.25 
 
 		 343 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 343 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  91.55 
 
 		 343 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  87.17 
 
 		 343 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  86.3 
 
 		 343 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  86.3 
 
 		 343 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  85.71 
 
 		 343 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  84.26 
 
 		 343 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  81.63 
 
 		 343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  78.43 
 
 		 339 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  78.4 
 
 		 334 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  56.18 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  54.84 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  57.1 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  48.53 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  48.55 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  46.2 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  47.69 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  45.69 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  46.2 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  46.26 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  45.69 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  45.69 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  45.69 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  44.7 
 
 		 350 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.38 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  44.38 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  44.38 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  45.35 
 
 		 353 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  48.55 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  45.48 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  45.06 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  48.23 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  44.09 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  44.48 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  47.59 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  48.54 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  43.31 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  46.95 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  45.7 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  45.95 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  45.95 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  43.64 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  48.21 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  46.3 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  46.3 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  45.98 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  43.15 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  46.3 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  43.64 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  42.9 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  42.98 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  43.19 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.36 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  42.28 
 
 		 367 aa  255  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  42.59 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  46.21 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  38.94 
 
 		 325 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  38.81 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  45.02 
 
 		 289 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  38.89 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.24 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.71 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  40.48 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.72 
 
 		 319 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  41 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  40.33 
 
 		 313 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  40.21 
 
 		 313 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  39.46 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  38.72 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  39.39 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  38.54 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  39.06 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  39.52 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  38.85 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  38.67 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  39.06 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  39.18 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.2 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>