More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2495 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  100 
 
 		 368 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  71.59 
 
 		 344 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  65.45 
 
 		 361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  61.84 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  56.56 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  55.35 
 
 		 350 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.89 
 
 		 351 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  61.81 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  54.21 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  57.23 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  52.99 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  55.1 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  53.54 
 
 		 371 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  52.15 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  54.9 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.9 
 
 		 333 aa  325  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  55.07 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.04 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  54.55 
 
 		 374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  57.43 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  55.79 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.43 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  54.13 
 
 		 343 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  55.75 
 
 		 330 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  54.08 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  53.08 
 
 		 339 aa  292  8e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.72 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.28 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  49.15 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  55.83 
 
 		 330 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.73 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  51.74 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  52.91 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  53.25 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  53.25 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  52.66 
 
 		 326 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.66 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1278  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.46 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00470592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.54 
 
 		 319 aa  126  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  35.15 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  33.79 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  33.79 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.01 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.23 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.23 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  32.23 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.23 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.21 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.39 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.39 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.86 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  31.41 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.91 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  33.7 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  31.19 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  33.57 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  33.56 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.35 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.45 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  31.73 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0523  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.32 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.66 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  30.63 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  31.73 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.32 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.32 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  30.39 
 
 		 343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  32.57 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.13 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  29.87 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.77 
 
 		 350 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  31.77 
 
 		 350 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.96 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  31.89 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  28.87 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.08 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  31.97 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.03 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.75 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.28 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>