More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1096 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  100 
 
 		 330 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  77.91 
 
 		 343 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  79.34 
 
 		 326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  79.34 
 
 		 326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  79.02 
 
 		 326 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  74.36 
 
 		 326 aa  447  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  75.96 
 
 		 326 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  66.26 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  73.94 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  69.21 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  55.97 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.9 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.51 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  56.5 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  56.78 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  58.9 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  57.99 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  58.36 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  57.69 
 
 		 374 aa  318  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  54.95 
 
 		 349 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  55.42 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  54.05 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  55.08 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  55.49 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  55.1 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.48 
 
 		 348 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  54.83 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.67 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  56.58 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.07 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  48.03 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.1 
 
 		 366 aa  297  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  59.15 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  50.48 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  55.46 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  54.4 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.98 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.28 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.83 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  32.92 
 
 		 352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  36.1 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.4 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  36.1 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.2 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  38.87 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  38.58 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  38.58 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  38.58 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.82 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  30.26 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  36.16 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.25 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  38.74 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.18 
 
 		 354 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  28.16 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  38.74 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  36.51 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  36.08 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.61 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.06 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.5 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  36.12 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  38.29 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  33.18 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  34.63 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  38.29 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  38.29 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  38.29 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.5 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.37 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.9 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  34.39 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  28.57 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  30.08 
 
 		 290 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  31.48 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1115  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.08 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>