More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1168 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 296 aa  614  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  56.71 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  49.68 
 
 		 307 aa  302  5.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  52.22 
 
 		 290 aa  295  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  48.3 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  50.85 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  46.26 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  46.6 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  46.6 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  46.6 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  46.6 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  46.6 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  46.6 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  46.6 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  47.28 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  47.32 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  45.42 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  45.42 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  45.24 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  44.22 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.29 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  39.8 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  39.8 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.43 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  42.66 
 
 		 279 aa  222  7e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.8 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.1 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  36.79 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.18 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.97 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.33 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.86 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.21 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.29 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.22 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  40.7 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.85 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  40.7 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.97 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.42 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.41 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  38.7 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.05 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.05 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.97 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.92 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.66 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.79 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  36.72 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.89 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  32.48 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  34.23 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  36.24 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.92 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  39.41 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  39.41 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  39.7 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  39.41 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  39.41 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.81 
 
 		 354 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  39.41 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  37.78 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  38.66 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  35.13 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.76 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.82 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.73 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  31.58 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  37.78 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.57 
 
 		 347 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  32.43 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  31.77 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  31.77 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  31.77 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  31.77 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  33.83 
 
 		 343 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  31 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.49 
 
 		 354 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.51 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1697  GTPase EngC  35.59 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.49 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.49 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1480  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.5 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  31.29 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.33 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  33.46 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1467  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.74 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  33.46 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>