More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  100 
 
 		 344 aa  680    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  71.31 
 
 		 368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  73.85 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  68.8 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  62.02 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  59 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  66.38 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  58.53 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.64 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  61.9 
 
 		 331 aa  352  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  59.3 
 
 		 355 aa  351  8.999999999999999e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  56.82 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.19 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  62.62 
 
 		 337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  59.03 
 
 		 339 aa  335  7e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.45 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  57.23 
 
 		 343 aa  332  8e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  58.88 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  52.12 
 
 		 371 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  51.68 
 
 		 371 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  56.79 
 
 		 334 aa  322  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  56.27 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.85 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  54.42 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  56.78 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.69 
 
 		 338 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.44 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  55.72 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.39 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  51.32 
 
 		 336 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  55.7 
 
 		 326 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  55.7 
 
 		 326 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  52.17 
 
 		 326 aa  291  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  55.06 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  55.59 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  55.48 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.91 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.38 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.37 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  31.94 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.21 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1842  GTPase EngC  36.76 
 
 		 257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  37.55 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  35.48 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  35.38 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  35.48 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  33.76 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.15 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.69 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  34.14 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  36 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.92 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  33.14 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  33.14 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  33.14 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  34.72 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.93 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  33.23 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  32.93 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33.1 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.93 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  34.72 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.93 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  35.18 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.5 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.93 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  35.13 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.65 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  37.4 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  35.13 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  32.75 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.33 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  34.52 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  38.63 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  34.52 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.88 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.72 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.95 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  31.93 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.77 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.64 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  30.6 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1278  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.75 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00470592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.34 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>