More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00550 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 347 aa  712    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  66.47 
 
 		 342 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  59.24 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  58.6 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  58.6 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  58.31 
 
 		 354 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  57.77 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  58.6 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  58.6 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  57.73 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  57.43 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  58.77 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  57.73 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  58.36 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  57.76 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  57.65 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  57.27 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  58.41 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  54.65 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  58.31 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  58.31 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  58.31 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  58.7 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  58.41 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  57.77 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  58.7 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  58.7 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  58.7 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  58.7 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  56.4 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  57.48 
 
 		 353 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  59 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  58.7 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  54.23 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  55.46 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  54.81 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  55.07 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  57.44 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  57.4 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  57.44 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  57.44 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  57.69 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  55.95 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  56.8 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  57.14 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  57.74 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  51.88 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  44.35 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  44.93 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  44.64 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  44.64 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  44.35 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  44.19 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  42.9 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  43.19 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  43.27 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  42.9 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  41.62 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  43.48 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  47.64 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  47.64 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  48.12 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  37.23 
 
 		 367 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.25 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.73 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  40.68 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  39.81 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  43.71 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  36.87 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  40.86 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  41.22 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  38.54 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 314 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  42.52 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.61 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1568  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.13 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  39.02 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  37.8 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 		 287 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.78 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  36.99 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  38.38 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  36.3 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.69 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>