More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1699 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  100 
 
 		 337 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  61.05 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  61.13 
 
 		 349 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  65.79 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  59.25 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  58.79 
 
 		 350 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  62.46 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  61.96 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.35 
 
 		 338 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  65.18 
 
 		 334 aa  339  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  59.25 
 
 		 361 aa  338  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  59.75 
 
 		 334 aa  335  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  60.32 
 
 		 374 aa  328  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.29 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  56.1 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  54.52 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  52.25 
 
 		 371 aa  326  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  54.41 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  59.93 
 
 		 339 aa  322  8e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.62 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  56.74 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  54.95 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  58.55 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.71 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  53.19 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  56.15 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  55.9 
 
 		 336 aa  301  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.93 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.83 
 
 		 348 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  53.47 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  51.1 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  53.92 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  53.57 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  52.55 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  52.55 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  52.06 
 
 		 326 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  39.64 
 
 		 343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  39.64 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  39.64 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  40 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  42.79 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  40.43 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.38 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.27 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  39.27 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  40.61 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  38.27 
 
 		 354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  38.27 
 
 		 354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  38.27 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  37.82 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.62 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  36.43 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  43.67 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.74 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  35.56 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  44.54 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  34.98 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.15 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  34.98 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  44.1 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.77 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  35.38 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  34.3 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  34.94 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  34.67 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  34.94 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  34.37 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  34.67 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.13 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  34.94 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  34.57 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  34.57 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  34.57 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  36.88 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  34.57 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.4 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  34.57 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  34.57 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  34.57 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.26 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  36.46 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.27 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  36.46 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  36.46 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  33.94 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.01 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  34.26 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  36.46 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  37.64 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  37.64 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  37.64 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>