More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0534 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  100 
 
 		 336 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  57.44 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  54.73 
 
 		 350 aa  348  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  58.58 
 
 		 331 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.08 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.1 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  56.65 
 
 		 339 aa  318  6e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  52.12 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  49.58 
 
 		 371 aa  315  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  53.08 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.99 
 
 		 338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  48.64 
 
 		 371 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  56.42 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  56.16 
 
 		 369 aa  301  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  51.32 
 
 		 344 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  54.05 
 
 		 330 aa  295  7e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.13 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  54.6 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.14 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  54.92 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  49.72 
 
 		 361 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  54.72 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  50.59 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  48.52 
 
 		 366 aa  282  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.77 
 
 		 366 aa  278  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.15 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  54.95 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  56.45 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  53.4 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  54.46 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  49.37 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  54.3 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  54.3 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  49.15 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  48.97 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  47.71 
 
 		 355 aa  255  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.16 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.74 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  36.26 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  36.19 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  36.64 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.95 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.37 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 354 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 354 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.95 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 354 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.64 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.95 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.04 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.3 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.03 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 354 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.15 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.89 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.14 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  37.32 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.35 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.03 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  35.8 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  34.96 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  35.77 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.63 
 
 		 347 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  31.77 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.94 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  34.5 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  34.23 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  34.25 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 353 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  31.29 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.12 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.15 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  26.62 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  33.94 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  39.31 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  35.6 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  39.76 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  37.05 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  26.3 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>