More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3589 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  100 
 
 		 343 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  77.91 
 
 		 330 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  71.79 
 
 		 326 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  74.36 
 
 		 326 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  73.11 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  73.11 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  72.79 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  71.7 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  63.83 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  66.56 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.29 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  53.78 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  52.16 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  53.09 
 
 		 361 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  55.88 
 
 		 369 aa  322  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.86 
 
 		 351 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  53.85 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  56.27 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  51.36 
 
 		 371 aa  318  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  54.68 
 
 		 331 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  52.74 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.12 
 
 		 366 aa  315  6e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  49.3 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.66 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  53.37 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  55.74 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  56.01 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  54.32 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  53.7 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.69 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  49.86 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  55.09 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.04 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  50.59 
 
 		 336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  53.33 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  53.4 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.86 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.73 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.05 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  37.56 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  37.05 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.75 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.7 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.99 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  36.56 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  31.47 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  34.52 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  36.08 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.86 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  35.84 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.46 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  35.65 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.65 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  37.81 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.46 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  35.18 
 
 		 313 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  37.81 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  37.81 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  35.18 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  35.18 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  29.2 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  33.85 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  35.09 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  32.94 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.56 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.12 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  32.94 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  35.71 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  30.65 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  28.78 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  35.04 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  31.71 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.8 
 
 		 355 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  34.62 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  34.12 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  34.43 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  31.89 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.47 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.47 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.56 
 
 		 306 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.47 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>