More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1900 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 315 aa  650    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  48.25 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  47.62 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  50.33 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  48.54 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  46.5 
 
 		 311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  43.97 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.93 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  42.26 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.42 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.42 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.62 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.62 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.89 
 
 		 319 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.66 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  34.82 
 
 		 354 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  35.53 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.19 
 
 		 354 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 352 aa  178  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.67 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  34.75 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  33.75 
 
 		 354 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.76 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  34.5 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.76 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.16 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  36.39 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  37.1 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.48 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.48 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.75 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.13 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 354 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.13 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.22 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  33.86 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  33.86 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  33.86 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  36.59 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0983  GTPase EngC  35.56 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.09 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.2 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  35.22 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  32.39 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  37.94 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  35.76 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.54 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.53 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  37.06 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.55 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  32.28 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  37.62 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  37.62 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  37.62 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  32.29 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  35.81 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.42 
 
 		 343 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.42 
 
 		 343 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  37.62 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  37.62 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  37.01 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  34.75 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  37.01 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  37.01 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  37.01 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  31.66 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.97 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  34.42 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  31.66 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  37.01 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.2 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  34.05 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.01 
 
 		 350 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 289 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.13 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 350 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  35.13 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>