More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1449 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  100 
 
 		 315 aa  648    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  36.99 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  37.91 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  38.66 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  35.74 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  34.64 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.66 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.5 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.29 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.57 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  33.76 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.09 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.02 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.06 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.41 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.2 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.25 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.55 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.62 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  36.66 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.67 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  34.71 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.77 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  32.8 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  34.11 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  34.29 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  34.62 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  34.71 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  32.21 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.79 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  32.49 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.65 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 349 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.34 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.19 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.55 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.56 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0983  GTPase EngC  29.85 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  32.69 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  30.63 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  30.63 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  30.63 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  34.27 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  32.91 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1409  GTPase EngC  30.72 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  32.17 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  31.91 
 
 		 354 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  34.08 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.75 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.01 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.01 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.01 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.62 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  33.56 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.72 
 
 		 375 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.29 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  32.81 
 
 		 293 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 293 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  31.96 
 
 		 353 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.22 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  31.79 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>