More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5830 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 308 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  67.32 
 
 		 311 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  52.96 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  51.48 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  51.67 
 
 		 311 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  48.84 
 
 		 315 aa  319  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  50.5 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  49.5 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  46.93 
 
 		 315 aa  288  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.48 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.97 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.76 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.97 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.08 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.3 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.45 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.09 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 		 349 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.37 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.46 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.83 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.83 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.83 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.41 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.42 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.37 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.37 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.05 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  36.21 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  35.08 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.75 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.94 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  32.48 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.77 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.08 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.13 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.15 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.15 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.15 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 352 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  35.1 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  36.45 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.76 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  35.31 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  178  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 		 350 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.74 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  34.1 
 
 		 349 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  32.15 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  34.98 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  31.61 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  32.78 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.94 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.81 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  35.77 
 
 		 354 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  32.6 
 
 		 351 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.11 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  35.08 
 
 		 332 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  35.03 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 372 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.06 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 313 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  36.63 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  32.44 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>