More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0575 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 294 aa  594  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.82 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.05 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.98 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.75 
 
 		 294 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  45.42 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.65 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.64 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.14 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  41.69 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  45.15 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  45.15 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.58 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  40.68 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  40.42 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.82 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.02 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  39.93 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.66 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  40.56 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.16 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  39.93 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  38 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  40.41 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.36 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.67 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.36 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.89 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.07 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  39.01 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.24 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  35.25 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  35.25 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.66 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.23 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.77 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  35.81 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.14 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.01 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.15 
 
 		 375 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  34.34 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.64 
 
 		 370 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  34.73 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.59 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  36.15 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  29.9 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  34.62 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  34.53 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.53 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.9 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.44 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.9 
 
 		 354 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.29 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  34.29 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  35.71 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  34.94 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  35.05 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  33.97 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.22 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.55 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.09 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  35.38 
 
 		 364 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>