More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0355 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 312 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  69.77 
 
 		 315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  65.81 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  55.74 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  48.54 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  48.86 
 
 		 311 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  48.85 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  46.84 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.01 
 
 		 308 aa  278  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.06 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.07 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.07 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.34 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.13 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.06 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.1 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.77 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.5 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.13 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.18 
 
 		 319 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  34.45 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  37.09 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.24 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.63 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.78 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.79 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  34.42 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.78 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.02 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.13 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  36.66 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.21 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.09 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  34.45 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.23 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  35.63 
 
 		 350 aa  175  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.23 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.42 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  31.35 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.68 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.11 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  33.58 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  33.58 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.1 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  30.77 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  32.87 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  34.23 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.87 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  31.33 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  31.71 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  32.69 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  31.17 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.46 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  32.69 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  36.89 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 354 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.67 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 354 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 354 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  35.91 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  31.96 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  31.79 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>