More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1224 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  100 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.74 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.52 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.4 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.93 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  44.52 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.36 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.36 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  45.89 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.11 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.79 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.78 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.78 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.46 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  42.81 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.99 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.87 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.64 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  41.3 
 
 		 293 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.79 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.31 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  40.61 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  40.94 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.59 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  40.58 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.03 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.64 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  34.45 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  36.24 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  36.3 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  38.41 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  35.96 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.89 
 
 		 375 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.72 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.46 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.79 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  35.84 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  35.25 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  35.25 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  36.18 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.24 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.01 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  34.45 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  32.26 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  33.89 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.27 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.81 
 
 		 370 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  37.69 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.21 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  36.46 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 		 405 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.2 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  32.63 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  32.23 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  29.67 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  34.29 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  31.62 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  32.72 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  32.33 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.11 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  32.33 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  32.33 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  32.33 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  32.54 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  32.33 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.15 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  34.9 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  32.99 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.56 
 
 		 347 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  32.07 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  30.61 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  32.33 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>