More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3843 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 296 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.17 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.67 
 
 		 292 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  51.18 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.46 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  49.16 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  47.47 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.64 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  45.12 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  45.45 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  45.79 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  44.93 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.48 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.28 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.81 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.11 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.34 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.34 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.42 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  41.58 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  40.86 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  38.67 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.58 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.4 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.18 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  39.93 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.18 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.59 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.89 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.53 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  38.41 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  37.04 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.46 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  37.84 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.38 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.25 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.33 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.49 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  35.57 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  35.57 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.67 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.01 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  40.36 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  39.93 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  41.03 
 
 		 364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  34.84 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.4 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  41.16 
 
 		 380 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  37.59 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  39.04 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  34.31 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  40.44 
 
 		 405 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  38.18 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.94 
 
 		 375 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.84 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  37.84 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  36.82 
 
 		 350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  36.82 
 
 		 350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  36.82 
 
 		 350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  37.04 
 
 		 350 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  36.82 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  41.03 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  38.1 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  38.1 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  34.21 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  39.35 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  38.1 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  38.1 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  36.49 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  39.58 
 
 		 374 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.62 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  32.2 
 
 		 279 aa  161  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 351 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  39.78 
 
 		 339 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 349 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 354 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 354 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  36.71 
 
 		 353 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  38.03 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  35.84 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>