More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1014 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 316 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  95.89 
 
 		 316 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  83.18 
 
 		 317 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  79.68 
 
 		 313 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  80 
 
 		 313 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  80 
 
 		 313 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  80 
 
 		 313 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  79.68 
 
 		 313 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  79.68 
 
 		 313 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  79.23 
 
 		 314 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  79.23 
 
 		 314 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  78.91 
 
 		 314 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  81.73 
 
 		 316 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  78.91 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  78.27 
 
 		 314 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  78.27 
 
 		 314 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  78.27 
 
 		 314 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  78.27 
 
 		 314 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  65.18 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  66.34 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  68.09 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  64.31 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  65.22 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  53.45 
 
 		 289 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1409  GTPase EngC  50.84 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1697  GTPase EngC  50.47 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1467  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.33 
 
 		 302 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  52.72 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  54.08 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0983  GTPase EngC  50.81 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5339  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.92 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1278  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.67 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00470592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1480  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.21 
 
 		 318 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137644  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0523  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.67 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.07 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  50.85 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0321  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3349  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.76 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.123821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.77 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  47.06 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1842  GTPase EngC  51.03 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  40.88 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  40.88 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  40.88 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  40.88 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  39.49 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  38.26 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  38 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  38.59 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  37.46 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  40.54 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  37.12 
 
 		 353 aa  192  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.54 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  38.54 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  36.54 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  42.37 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  37 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  38.38 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  36.12 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  36.12 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  36.12 
 
 		 354 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  36.12 
 
 		 354 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 		 349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.31 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  38.67 
 
 		 372 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  41.64 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  36.09 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.54 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  36.88 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  36.31 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  36.31 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  37.01 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  36.31 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  41.3 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.54 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  38.11 
 
 		 349 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.54 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  40.2 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 350 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 350 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 350 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  36.75 
 
 		 353 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  36.33 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 350 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.2 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  36.93 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.6 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  36.6 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  36.67 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  36.27 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>