More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2668 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  97.85 
 
 
325 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  674    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  41.89 
 
 
349 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.04 
 
 
350 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  42.04 
 
 
350 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  41.74 
 
 
350 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  41.74 
 
 
350 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  41.74 
 
 
350 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  39.82 
 
 
349 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  41.74 
 
 
350 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  41.74 
 
 
350 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  41.74 
 
 
350 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  42.77 
 
 
372 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  41.74 
 
 
350 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  42.06 
 
 
350 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  42.06 
 
 
350 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  42.06 
 
 
350 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  41.4 
 
 
349 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  41.76 
 
 
350 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  41.76 
 
 
350 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  41.49 
 
 
353 aa  259  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  41.54 
 
 
354 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  41.59 
 
 
349 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  41.18 
 
 
350 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  41.18 
 
 
350 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  41.18 
 
 
350 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  40.6 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  41.3 
 
 
349 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  42.24 
 
 
351 aa  252  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  40.48 
 
 
347 aa  252  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  39.36 
 
 
350 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  40.42 
 
 
352 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  40.54 
 
 
358 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  41.25 
 
 
351 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.4 
 
 
343 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  40.59 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  39.4 
 
 
343 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  38.67 
 
 
353 aa  239  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  42.09 
 
 
354 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  42.09 
 
 
354 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  41.95 
 
 
337 aa  238  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  38.62 
 
 
352 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  42.09 
 
 
340 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  42.09 
 
 
354 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  39.81 
 
 
347 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.81 
 
 
343 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  39.4 
 
 
343 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  39.4 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  38.51 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  39.4 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  39.1 
 
 
343 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  37.24 
 
 
343 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 
353 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  41.98 
 
 
351 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  38.12 
 
 
354 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 
354 aa  228  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  38.72 
 
 
354 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 
354 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 
354 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 
354 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  43.04 
 
 
340 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 
343 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  42.96 
 
 
289 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  38.48 
 
 
342 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  39.45 
 
 
299 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  36.6 
 
 
352 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  39.27 
 
 
339 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 
334 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  37.8 
 
 
313 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  37.19 
 
 
287 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.44 
 
 
296 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  36.9 
 
 
313 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.16 
 
 
300 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  36.9 
 
 
315 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  36.9 
 
 
315 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  38.28 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 
318 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  36.55 
 
 
313 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 
323 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  37.11 
 
 
316 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 
316 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  36.55 
 
 
313 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  36.55 
 
 
313 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 
316 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  37.11 
 
 
314 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  37.11 
 
 
314 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
314 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
314 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
314 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  32.41 
 
 
367 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
314 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  34.63 
 
 
314 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.74 
 
 
334 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 
314 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  35.05 
 
 
289 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 
319 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1568  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.44 
 
 
321 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>