More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0952 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 313 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  99.68 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  98.4 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  98.4 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  98.4 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  98.08 
 
 		 313 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  95.21 
 
 		 313 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  91.4 
 
 		 314 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  91.4 
 
 		 314 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  91.08 
 
 		 314 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  90.13 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  90.13 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  90.19 
 
 		 316 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  90.13 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  90.13 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  85.52 
 
 		 317 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  81.27 
 
 		 316 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  79.68 
 
 		 316 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  67.69 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  68.03 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  68.03 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  65.2 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  62.93 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  57.14 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0983  GTPase EngC  53.62 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5339  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.16 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1409  GTPase EngC  51.01 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1480  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.63 
 
 		 318 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  53.26 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1467  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.33 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1278  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.03 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00470592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  51.66 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1697  GTPase EngC  47.85 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.36 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  49.83 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0523  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.67 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.7 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3349  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.72 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.123821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0321  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.49 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  45.48 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1842  GTPase EngC  50.79 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  40.34 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 351 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  37.84 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  37.12 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  41.24 
 
 		 343 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  41.24 
 
 		 343 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  41.24 
 
 		 343 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  40.89 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  41.24 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  40.89 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  38.12 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  38.12 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  38.12 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  36.51 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.86 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  38.87 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 353 aa  189  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 347 aa  188  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  36.24 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.96 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  39.74 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  38.41 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  38.85 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.75 
 
 		 350 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 350 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  38.08 
 
 		 350 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  38.08 
 
 		 350 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  38.08 
 
 		 350 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 350 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 344 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  35.96 
 
 		 352 aa  185  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  37.42 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.59 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.59 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.59 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.59 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  38.08 
 
 		 350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  38.51 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 354 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  41.67 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  41.67 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  38.83 
 
 		 299 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  34.8 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  36.55 
 
 		 325 aa  178  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  36.88 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>