More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09970 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.45 
 
 
292 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.58 
 
 
294 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.81 
 
 
293 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.93 
 
 
293 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.01 
 
 
292 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  43.1 
 
 
293 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  42.11 
 
 
294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  42.56 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  41.52 
 
 
293 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  41.52 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  41.52 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  41.87 
 
 
293 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  40.14 
 
 
290 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.72 
 
 
288 aa  205  6e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.58 
 
 
292 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.7 
 
 
290 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  39.1 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.86 
 
 
296 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  38.19 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.48 
 
 
316 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.52 
 
 
300 aa  195  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  36.7 
 
 
307 aa  191  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.11 
 
 
293 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.76 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.67 
 
 
306 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.49 
 
 
296 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.33 
 
 
305 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  37.01 
 
 
295 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.89 
 
 
354 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 
287 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  37.09 
 
 
287 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.09 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  36.58 
 
 
337 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.27 
 
 
294 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  35.35 
 
 
352 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.21 
 
 
354 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.21 
 
 
354 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 
354 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 
351 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 
354 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.79 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.67 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.88 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.98 
 
 
302 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.73 
 
 
322 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 
307 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.28 
 
 
319 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.77 
 
 
370 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 
288 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 
340 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 
354 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 
354 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 
354 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  39.1 
 
 
297 aa  175  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  34.47 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.84 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  38.66 
 
 
370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.07 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  38.13 
 
 
376 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  34.14 
 
 
291 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  38.13 
 
 
405 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  34.14 
 
 
291 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  35.47 
 
 
342 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 
325 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  34.75 
 
 
306 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  37.45 
 
 
352 aa  166  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  34.9 
 
 
347 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.78 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  35.51 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  34.41 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  31.15 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  35.45 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 
347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  36.91 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  33.33 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 
353 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.34 
 
 
375 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.78 
 
 
293 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  36.3 
 
 
312 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 
374 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  36.27 
 
 
312 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.27 
 
 
318 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 
290 aa  159  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  38.52 
 
 
380 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  33.11 
 
 
315 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  29.68 
 
 
311 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  37.39 
 
 
319 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  36.82 
 
 
289 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>