More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0765 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.24 
 
 
296 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 
293 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 
293 aa  248  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  44.03 
 
 
293 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  43.88 
 
 
293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  43.6 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  44.64 
 
 
291 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  44.64 
 
 
291 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  41.41 
 
 
307 aa  237  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  43.64 
 
 
295 aa  236  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  42.66 
 
 
293 aa  234  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  42.32 
 
 
290 aa  230  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  41.61 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  38.87 
 
 
287 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  40.78 
 
 
279 aa  194  2e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.62 
 
 
290 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  38.52 
 
 
287 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.12 
 
 
301 aa  188  8e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 
293 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.97 
 
 
294 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.66 
 
 
294 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.55 
 
 
305 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.55 
 
 
292 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.1 
 
 
282 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.05 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.84 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 
290 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  38.41 
 
 
294 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.47 
 
 
292 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.17 
 
 
288 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.07 
 
 
302 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  36.84 
 
 
290 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.73 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.36 
 
 
354 aa  162  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
354 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.01 
 
 
295 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
354 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.01 
 
 
293 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.92 
 
 
293 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 
350 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  31.39 
 
 
354 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  33 
 
 
354 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.33 
 
 
300 aa  157  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.92 
 
 
288 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.41 
 
 
292 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 
311 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.79 
 
 
319 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  30.16 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.67 
 
 
319 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.01 
 
 
306 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  31.65 
 
 
306 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  31.07 
 
 
340 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  31.07 
 
 
354 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  31.07 
 
 
354 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  30.74 
 
 
354 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  31.76 
 
 
343 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  30.48 
 
 
354 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  36.47 
 
 
298 aa  149  5e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  29.64 
 
 
353 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  29.41 
 
 
352 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.3 
 
 
300 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  30.39 
 
 
343 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  31.27 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.89 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  31.27 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  30.93 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  31.83 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  31.83 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  31.4 
 
 
343 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  29.55 
 
 
352 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  31.02 
 
 
347 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.51 
 
 
293 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  29.39 
 
 
353 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.11 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  31.4 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.04 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  32.12 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  29.77 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  33.09 
 
 
316 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  34.59 
 
 
289 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  30.59 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  30.84 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  29.7 
 
 
350 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  29.7 
 
 
350 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  29.7 
 
 
350 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  31.35 
 
 
313 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  30.26 
 
 
316 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  30.43 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  29.93 
 
 
350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  31.46 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>