More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1046 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.7 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  46.55 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  46.71 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  48.75 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  46.37 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  46.37 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  46.37 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  46.37 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  46.37 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  46.37 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  46.37 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  46.71 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  46.71 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.07 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.14 
 
 		 293 aa  238  9e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.57 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  44.29 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.48 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.75 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.64 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.07 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.51 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.07 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.26 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.58 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.02 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.7 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  41.97 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  39.93 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.42 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  41.61 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.21 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  40.34 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.93 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  39.8 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  42.31 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  37.15 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 		 319 aa  178  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  38.28 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.68 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.38 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.93 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  38.14 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.58 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  37.15 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  37.15 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.59 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.78 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.01 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.13 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.11 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  38.81 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.96 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 353 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  36.96 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.13 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.54 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.98 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.44 
 
 		 370 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  33.55 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 		 380 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  31.46 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  30.23 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  33.56 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  34.01 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  33.11 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 347 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  32.26 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  37.55 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  33.85 
 
 		 405 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  31.36 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.1 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.85 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  32.37 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  32.26 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  30.69 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.35 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  33.57 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  30.69 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.44 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>