More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl222 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl222  GTPase  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.77 
 
 
300 aa  319  3e-86  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  38.59 
 
 
293 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.79 
 
 
296 aa  209  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  34.23 
 
 
293 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  38.93 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  38.59 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  38.05 
 
 
295 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  35.69 
 
 
291 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  36.12 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  35.12 
 
 
290 aa  179  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.09 
 
 
292 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.33 
 
 
300 aa  171  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  35.67 
 
 
290 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  34.56 
 
 
291 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  34.56 
 
 
291 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.41 
 
 
288 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.49 
 
 
290 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.65 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.89 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.59 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  39.53 
 
 
279 aa  163  3e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  33.78 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.25 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.26 
 
 
319 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.66 
 
 
293 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.67 
 
 
292 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.97 
 
 
305 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.03 
 
 
293 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.12 
 
 
301 aa  151  1e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.63 
 
 
294 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  33.09 
 
 
287 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 
287 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  36.47 
 
 
297 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.64 
 
 
293 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.33 
 
 
293 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.01 
 
 
290 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  30.27 
 
 
289 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.47 
 
 
296 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  31.36 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  30.62 
 
 
325 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  28.2 
 
 
313 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  28.29 
 
 
313 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  31.71 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  28.29 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  28.29 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  29.93 
 
 
316 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  28.72 
 
 
350 aa  136  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  28.2 
 
 
313 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  28.2 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  27.96 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  27.96 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  28.87 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5339  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.41 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  28.2 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.58 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  29.15 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  27.96 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  29.07 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88792 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 
350 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 
350 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 
350 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 
350 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  29.23 
 
 
350 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 
350 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  30.77 
 
 
342 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 
350 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  28.52 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  28.52 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  28.52 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  29.77 
 
 
314 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  29.77 
 
 
314 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  28.52 
 
 
350 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  29.77 
 
 
314 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  29.77 
 
 
314 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  31.27 
 
 
315 aa  132  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  27.63 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  30.39 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1278  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.39 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00470592  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  30.45 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  30.9 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 
350 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  27.76 
 
 
290 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  28.01 
 
 
351 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  26.86 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  28.47 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.41 
 
 
346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.06 
 
 
300 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>