More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2076 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 350 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  56.71 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  59.88 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  55.91 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  57.02 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  54.52 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.87 
 
 		 370 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  55.08 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  51.41 
 
 		 304 aa  259  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  48.14 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  43.73 
 
 		 312 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  43.39 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00231  GTPase  48.31 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  40.73 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  46.41 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  36.21 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  36.14 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00181  GTPases  35.22 
 
 		 305 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  35.31 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.66 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  39.25 
 
 		 293 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.96 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  38.91 
 
 		 293 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  38.91 
 
 		 293 aa  186  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  38.91 
 
 		 293 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  38.91 
 
 		 293 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  38.91 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  38.57 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  38.57 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  38.91 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  38.57 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  37.88 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.15 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.64 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.78 
 
 		 292 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 287 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  38.78 
 
 		 293 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.97 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.87 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.03 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.17 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.35 
 
 		 291 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  37.84 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.96 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.34 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.95 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  35.98 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.27 
 
 		 300 aa  157  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.07 
 
 		 288 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.09 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.34 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.09 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  35.03 
 
 		 290 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  34.41 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  34.55 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.89 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.3 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.89 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  32.54 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.38 
 
 		 282 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  37.12 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  33.85 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  33.85 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.53 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  34.49 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.87 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 354 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.67 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.29 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  34.49 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.49 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  34.4 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  31.4 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  35.46 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  33.8 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  36.3 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  33.9 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  36.3 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  36.3 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.22 
 
 		 375 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  36.3 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.01 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  33.69 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  35.41 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  35.64 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  35.64 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.44 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.82 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>