More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00181 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00181  GTPases  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  88.85 
 
 		 305 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  82.95 
 
 		 305 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  70.49 
 
 		 305 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  38.49 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  40.15 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  39.77 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  37.5 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  35.79 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00231  GTPase  36.55 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  32.12 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  34.8 
 
 		 376 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  34.46 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.71 
 
 		 370 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  32.45 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  33.2 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  30.55 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.25 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.96 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.21 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.08 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.37 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.25 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  33.57 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.14 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.97 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.94 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  32.83 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  32.83 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.97 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.96 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  32.28 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  32.28 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.74 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  27.43 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.27 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  32.28 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  31.23 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  31.23 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  31.23 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  31.23 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  31.56 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  29.45 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  30.83 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  29.55 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  31.5 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  30.83 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.43 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  30.07 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  29.57 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  29.33 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.92 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.99 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  28.21 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  28.21 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  28.21 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  28.21 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  29.49 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.6 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  29.45 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  28.77 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  24.53 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  29.3 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  27.09 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  33.2 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  30.68 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  33.07 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  32.27 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  29.17 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  30.91 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  31 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  31 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.33 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  26.1 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  26.9 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  26.85 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  29.51 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  27.24 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.83 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  27.6 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.92 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  27.53 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  26.6 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  26.6 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  26.92 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  26.6 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.62 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>