More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1341 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  39.37 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  39.86 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  41.11 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  39.37 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  39.37 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  38.11 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.04 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.57 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  38.14 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.9 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.33 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.99 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.48 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.48 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.06 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.24 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  37.99 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  37.63 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.98 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.99 
 
 		 300 aa  178  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.68 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  35.56 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  34.86 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.89 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  34.4 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  38.26 
 
 		 370 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  35.56 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  35.56 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.42 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.64 
 
 		 370 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  35.79 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 405 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.32 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  33.92 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  34.71 
 
 		 374 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.86 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  34.34 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.36 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  31.56 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.76 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.61 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.33 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  34.13 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.67 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  31.35 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  29.9 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.08 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  32.41 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.12 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.49 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  30.74 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  36.55 
 
 		 352 aa  137  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.22 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  31.02 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  33.58 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.07 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  30 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  30.13 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.79 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  32.28 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.77 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  32.76 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.97 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  33.09 
 
 		 344 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  30.48 
 
 		 351 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.55 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  31.7 
 
 		 312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  33.08 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.22 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.55 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  35.75 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  38.62 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  34 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  30.74 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  31.7 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  29.33 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.32 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.32 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  30.33 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.32 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  32.32 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.8 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  29.1 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  29.1 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  34.5 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>