More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2044 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 
293 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.24 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  37.81 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 
293 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.25 
 
 
294 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.9 
 
 
292 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 
293 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 
293 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 
293 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 
293 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.91 
 
 
292 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 
290 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  36.88 
 
 
293 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  37.59 
 
 
307 aa  186  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.33 
 
 
291 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.61 
 
 
294 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  36.81 
 
 
290 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.92 
 
 
293 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.49 
 
 
290 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  37.41 
 
 
287 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.93 
 
 
305 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.01 
 
 
296 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.38 
 
 
290 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  37.05 
 
 
287 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.29 
 
 
288 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.77 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.66 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  36.11 
 
 
291 aa  169  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  35.74 
 
 
295 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  31.93 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  36.27 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.87 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.51 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  37.11 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  37.11 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.06 
 
 
293 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.06 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.78 
 
 
282 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  34.98 
 
 
279 aa  157  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  31.33 
 
 
311 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  33 
 
 
315 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  31.82 
 
 
349 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  31.35 
 
 
306 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.49 
 
 
319 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  34.64 
 
 
298 aa  149  6e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.08 
 
 
306 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.17 
 
 
319 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 
374 aa  148  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  31.79 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.82 
 
 
293 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  31.17 
 
 
349 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.48 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.1 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  30.52 
 
 
349 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  30.52 
 
 
349 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  30.52 
 
 
349 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  30.52 
 
 
364 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  30.77 
 
 
349 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  30.52 
 
 
364 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  30.52 
 
 
364 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  32.51 
 
 
297 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  30.19 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.82 
 
 
370 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.21 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.39 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 
300 aa  139  7e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  34.27 
 
 
312 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  32.77 
 
 
376 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  30.09 
 
 
370 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  32.77 
 
 
405 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.22 
 
 
288 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  34.27 
 
 
312 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  32.62 
 
 
313 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.07 
 
 
359 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.77 
 
 
316 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  28.57 
 
 
340 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  29.24 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  30.22 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
350 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.49 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.93 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.29 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  29.93 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.03 
 
 
359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  30.27 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  29.58 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  28.62 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.79 
 
 
386 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  29.49 
 
 
315 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.493781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>