More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0261 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  56.77 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  37.21 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.41 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.54 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  35.1 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  39.15 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  36.54 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  37.09 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  37.33 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.86 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  38.08 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  37.42 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  36.75 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.46 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.68 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.44 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.45 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  36.26 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.67 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.48 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  37.2 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  34.33 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.02 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  37.94 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  35.42 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  35.42 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  36.71 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.49 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  36.71 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.17 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.78 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  31.74 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.22 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.65 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.81 
 
 		 301 aa  152  1e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.43 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  32.05 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  32.43 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.05 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.05 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.05 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.05 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.05 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  30.5 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.05 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  28.96 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  31.11 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.93 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  30.92 
 
 		 351 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  31.07 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  29.96 
 
 		 353 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  30.5 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  30.5 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1409  GTPase EngC  34.81 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  32.29 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  30.5 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  30.5 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  30.5 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  29.57 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  29.34 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  29.12 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  31.7 
 
 		 287 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  30.89 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  28.82 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  29.34 
 
 		 354 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  30.77 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  30.89 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  31.01 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  31.01 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  30.38 
 
 		 354 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  28.96 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  28.19 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  28.19 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  28.19 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  28.19 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  31.95 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>