More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0787 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  72.85 
 
 		 291 aa  447  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  72.85 
 
 		 291 aa  447  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  46.67 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  47.14 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  46.42 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  46.46 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  46.46 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  46.42 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  46.46 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  46.46 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  46.42 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  45.73 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  45.73 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  45.73 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  46.58 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  42.62 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  43.6 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  44.18 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  43.75 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.22 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.65 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.4 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.34 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.07 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.54 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.04 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.66 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.52 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.74 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.74 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.93 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  38.38 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  38.2 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  35.69 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.99 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.37 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.28 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.56 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.95 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.47 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.68 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.26 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.11 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.34 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.91 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  35.84 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  34.41 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.21 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  35.17 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.57 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  32.66 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.69 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  35.91 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  33.67 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  30.77 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  32.87 
 
 		 350 aa  152  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  32.64 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  31.62 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  32.3 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  32.54 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  32.17 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.99 
 
 		 350 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  34.02 
 
 		 324 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 		 350 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  32.87 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  31.9 
 
 		 349 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.03 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.19 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.65 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.06 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.43 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  32.27 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  32.53 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  32 
 
 		 354 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  32.27 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  32.27 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  30.39 
 
 		 349 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  31.54 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>