More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2303 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 294 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.7 
 
 		 292 aa  362  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  52.23 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.89 
 
 		 292 aa  301  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.17 
 
 		 296 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.8 
 
 		 293 aa  295  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.07 
 
 		 293 aa  292  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  48.96 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  48.65 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.83 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  45.52 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.96 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  48.18 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  47.81 
 
 		 287 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  46.53 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  45.42 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  45.42 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  45.42 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  45.08 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.17 
 
 		 294 aa  244  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.86 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.13 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.07 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.47 
 
 		 295 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.47 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.61 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.23 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  43.54 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.29 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.58 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  43.4 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.76 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.05 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.45 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.64 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  41.1 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.29 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  42.52 
 
 		 380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  40.52 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  40.77 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  36.75 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  39.22 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.91 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  40.4 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 370 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.04 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  40.54 
 
 		 364 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  40.51 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.67 
 
 		 370 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  37.63 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  37.63 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  37.34 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  34.77 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.25 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  37.46 
 
 		 351 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.76 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.6 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.37 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  37.24 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.95 
 
 		 337 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  35.1 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.53 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  36.08 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  35.05 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 349 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  36.15 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  35.66 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  34.32 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  34.63 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.63 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  38.82 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.63 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  34.63 
 
 		 354 aa  175  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  37.05 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  35.9 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  38.52 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.53 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  35.49 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  36.18 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  35.37 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 347 aa  171  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.19 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  33.44 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.53 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>